Se jugarán partidos de ida y vuelta entre el 24 de octubre y 1 de noviembre.
Lunes 19 de octubre de 2020.- La Federación Ecuatoriana de Fútbol (FEF) realizó el sorteo de los dieciseisavos de final de la Segunda Etapa / Play-off que jugarán los 32 equipos clasificados a esta instancia: 22 campeones provinciales y los vicecampeones de las 10 Asociaciones Provinciales con el mayor número de clubes participantes.
Así se jugarán los dieciseisavos de final
Ante la presencia del notario Geovanny Guzmán, durante la sesión de Comité Ejecutivo de la FEF se procedió al sorteo. El cruce de las llaves quedó establecido de la siguiente manera:
16 avos de final (ida)
| C.S. Venecia (16) | VS | Imbabura S.C. (13) |
| Pastaza S.C (7) | VS | C.D. Primero de Mayo (5) |
| C.S.D Ciudad de Pedernales (31) | VS | Cumbayá F.C. (3) |
| F.C Insutec (24) | VS | C.D. Aampetra (23) |
| C.D. La Unión (21) | VS | C.D Everest (18) |
| C.D. Dunamis 04 (30) | VS | Atacames S.C. (14) |
| Vargas Torres (17) | VS | Libertad F.C (10) |
| Club Deportivo Coca (27) | VS | C.S.C.D. Caribe Junior (2) |
| C.D Baldor B. Cabrera (29) | VS | C.D. Unibolívar (15) |
| Santa Elena (6) | VS | C.D. Atlético Saquisilí (4) |
| Cañar F.C (28) | VS | C.D. Universitario (25) |
| C.D. Leones del Norte (12) | VS | C.D. La Paz (1) |
| Bonita Banana S.C. (19) | VS | C.D. Alianza (8) |
| C.D. Gloria (32) | VS | Guayaquil S.C. (20) |
| Liga Deportiva Juvenil (26) | VS | C.D. Águilas (22) |
| C.S 3 de Julio (11) | VS | Azogues S.C (9) |
( ): Posición en la Tabla General de Rendimiento; el mejor ubicado cierra la llave como local.
Partidos de ida de vuelta
En dieciseisavos de final y las siguientes instancias se jugarán partidos de ida y vuelta; la localía para el partido de vuelta corresponderá siempre al equipo con mejor posición según la Tabla General de Rendimiento.
En caso de empates, se definirá mediante regla de goles anotados en condición de visitante; de persistir la igualdad, se procederá directamente a la definición por penales.
Próximas instancias
- Octavos de final (8 y 15 de noviembre).
- Cuartos de final (22 y 29 de noviembre).
- Semifinales (6 y 13 de diciembre).
- Final única (19 de diciembre).
- Campeón y subcampeón 2020 ascenderán a la LigaPro Serie B 2021.
Sede de la final única
La FEF deberá evaluar una serie de requisitos para escoger la sede de la final única entre los siguientes postulantes:
- Estadio Municipal Ciudad de Yantzaza, Asociación de Fútbol Profesional de Zamora Chinchipe.
- Estadio Olímpico Municipal de Otavalo El Batán, Asociación de Fútbol Profesional de Imbabura.
- Estadio de San Miguel de Bolívar, Asociación de Fútbol Profesional de Bolívar.
- Estadio Olímpico Tsáchila – Etho Vega Baquero, Asociación de Fútbol No Amateur de Santo Domingo de los Tsáchilas.
- Estadio del Complejo AFNACH – Yaruquíes, Asociación de Fútbol No Amateur de Chimborazo.
- Estadio Bellavista de Ambato, Asociación de Fútbol de Tungurahua.
- Estadio Alejandro Serrano Aguilar, Asociación de Fútbol del Azuay
Departamento de Comunicación FEF